Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sox13Q04891 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms