Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms