Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms