Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GscQ02591 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GscQ02591 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GscQ02591 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GscQ02591 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms