Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col1a2Q01149 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms