Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms