Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms