Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms