Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gfra1P97785 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms