Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Npas2P97460 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas2P97460 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms