Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smyd1P97443 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms