Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf1bP97358 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms