Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tp53bp1P70399 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tp53bp1P70399 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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