Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ufm1P61961 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ufm1P61961 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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