Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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