Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2fP61219 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2fP61219 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms