Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Strn4P58404 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Strn4P58404 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms