Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpa1P57784 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snrpa1P57784 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms