Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms