Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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