Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bace1P56818 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace1P56818 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms