Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1bbP56400 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1bbP56400 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms