Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab8aP55258 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms