Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nub1P54729 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms