Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClgnP52194 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClgnP52194 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClgnP52194 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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