Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tmod1P49813 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tmod1P49813 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tmod1P49813 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tmod1P49813 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms