Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psen1P49769 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psen1P49769 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psen1P49769 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms