Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms