Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdc2P43407 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdc2P43407 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms