Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ItgavP43406 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ItgavP43406 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms