Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ThpoP40226 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ThpoP40226 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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