Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtlP38585 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtlP38585 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms