Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RetP35546 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RetP35546 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RetP35546 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RetP35546 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RetP35546 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RetP35546 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RetP35546 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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