Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd1P33215 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd1P33215 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms