Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxc11P31313 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxc11P31313 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc11P31313 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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