Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms