Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pabpc1P29341 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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