Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp3P28862 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms