Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms