Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa3P28310 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms