Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms