Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PrkchP23298 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkchP23298 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkchP23298 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkchP23298 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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