Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TP20293 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TP20293 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TP20293 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TP20293 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TP20293 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TP20293 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TP20293 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TP20293 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TP20293 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms