Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P18529 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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P18529 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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P18529 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18529 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms