Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RaraP11416 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RaraP11416 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RaraP11416 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RaraP11416 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RaraP11416 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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