Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prf1P10820 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms