Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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