Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P06320 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P06320 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
P06320 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms