Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HbaP01942 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HbaP01942 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HbaP01942 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HbaP01942 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HbaP01942 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HbaP01942 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HbaP01942 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HbaP01942 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms