Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Foxq1O70220 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms